VIEW ARTICLE DOI: 10.1094/ASBCJ-56-0093
Identification of Hop Cultivars by DNA Marker Analysis. Shigeki Araki, Youichi Tsuchiya (1), Masachika Takashio, Teruo Tamaki, and Ken Shinotsuka, Brewing Research Laboratories, Sapporo Breweries Ltd., 10 Okatohme, Yaizu-Shi, Shizuoka, 425-0013 Japan. (1) Corresponding author. Phone: 011-81-54-629-7983. Fax: 011-81-54-629-3144. J. Am. Soc. Brew. Chem. 56(3):93-98, 1998. Accepted August 10, 1998.
We applied
random amplification
of polymorphic
DNA (RAPD) and
amplified fragment
length polymorphism
of hazy associations
(ALPHA) to the
identification
of hop cultivars.
The polymerase
chain reaction
(PCR) using
random primer
or sequence-tagged-sites
(STS) was found
to give a variety
of specific
fingerprints
from hop DNA,
requiring no
hop DNA sequence
information.
Varietal identification
of hops was
performed using
the fingerprints
that included
DNA fragment
polymorphisms.
Subsequently,
these RAPD (or
ALPHA) fragments
were sequenced,
and specific
primers for
the individual
RAPD (or ALPHA)
fragments were
synthesized.
The fragments
amplified by
the specific
primers allow
for a much clearer
identification
of hop cultivars.
Eleven typical
hop cultivars
were successfully
distinguished
from one another
using these
specific primers.
This method
was also useful
for the detection
of mixed samples
of hop cultivars.
Keywords: DNA
fingerprinting,
PCR, RAPD, Varietal
identification
Aplicamos
la amplificación
aleatoria de
DNA polimórfico
(RAPD) y polimorfismo
en la longitud
de fragmentos
amplificados
de asociaciones
(ALPHA) para
la identificación
de variedades
de lúpulo.
La reacción
en cadena de
la polimerasa
(PCR) usando
primers aleatorios
o sitios secuencia-etiquetados
(STS) se encontró
que dió
una variedad
de patrones
específicos
para el DNA
del lúpulo,
sin requerir
información
acerca de la
secuencia del
DNA del lúpulo.
Se realizó
la identificación
a nivel de variedades
de lúpulo,
usando los patrones
de los polimorfismos
de los fragmentos
de DNA. Subsecuentemente,
esos fragmentos
obtenidos de
RAPD (o ALPHA)
fueron secuenciados
y se sintetizaron
primers específicos
para los fragmentos
individuales
de RAPD (o ALPHA).
Los fragmentos
amplificados
por primers
especificos,
permitieron
una mucho más
clara identificación
de las variedades
de lúpulo.
Se distinguieron
con éxito
11 variedades
típicas
de lúpulo,
unas de otras,
usando esos
primers específicos.
Este método
también
resultó
útil
en la detección
de muestras
mezcladas de
variedades de
lúpulo.