VIEW ARTICLE DOI: 10.1094/ASBCJ-54-0172
Identification of Reproducible PCR-RAPD Markers that Enable the Differentiation of Closely Related Six-Rowed Malting Barley (Hordeum vulgare L.) Cultivars (1). David L. Hoffman and Phil Bregitzer, U.S. Department of Agriculture, Agricultural Research Service, National Small Grains Germplasm Research Facility, Aberdeen, ID 83210. (1) Mention of a company or specific product is for informational purposes only and is not intended to imply endorsement by the USDA-ARS. J. Am. Soc. Brew. Chem. 54(3):172-176. Accepted February 14, 1996. This article is in the public domain and not copyrightable. It may be freely reprinted with customary crediting of the source. American Society of Brewing Chemists, Inc., 1996.
Varietal
purity of barley
seed and malt
lots is important
to the malting
and brewing
industries.
This study was
conducted to
see if a modified
polymerase chain
reaction (PCR)
technique using
random DNA primers
(PCR-RAPD) could
generate repeatable
polymorphisms
among the closely
related six-rowed
malting cultivars
Morex, Robust,
Stander, Excel,
and elite breeding
line M77. From
a total of 80,
30 random 10-mer
primers were
selected based
on their ability
to generate
reproducible
polymorphisms
between the
cultivars Steptoe
and Morex. Bulked
DNA isolated
from the leaves
of 10-12 plants
of each cultivar
was amplified
using the Stoffel
fragment of
recombinant
Thermus aquaticus
DNA polymerase
and one primer
per PCR. Nine
of the 30 primers
detected repeatable
polymorphisms
among the malting
lines. Each
cultivar or
line could be
distinguished
from another
with the exception
of Stander and
M77. The results
of six primers
were reproduced
in a second
laboratory.
It was concluded
that this PCR-RAPD
technique could
be useful for
distinguishing
the four six-rowed
malting barley
cultivars. A
faster version
of the technique
may be required
for practical
cultivar identification
by the barley
processing industry.
Keywords: Cultivar
identification,
Malting barley,
PCR-RAPD, Reproducibility,
Stoffel fragment.
La
pureza varietal
de semilla de
cebada y lotes
de malta es
importante para
las industries
maltera y cervecera.
Este trabajo
fue realizado
para ver si
una técnica
modificada de
la reacción
de cadena de
polimerasa (PCR)
usando iniciadores
DNA al azar
podía
(PCR-RAPD) generar
repetibles polimorfismos
entre los cultivos
malteros estrechamente
relacionados
Morex, Robust,
Stander, Excel,
y la nueva línea
M77. Treinta
iniciadores
al azar fueron
seleccionados
basados en su
habilidad para
generar polimorfismos
ente los cultivos
Steptoe y Morex.
El DNA aislado
de hojas de
10 a 12 plantas
de cada cultivo
fue amplificado
usando el fragments
stoffel del
recombinants
Thermus aquaticus
DNA polimerasa
y un iniciador
al azar por
PCR. Nueve de
los treinta
iniciadores
detectaron polimorfismos
repetibles ente
las líneas
malteras. Cada
cultivo o línea
podía
ser distinguida
de cualquier
otra con los
resultados combinados
de los iniciadores
Stander y M77.
Los resultados
de seis iniciadores
fueron repetidos
en un segundo
laboratorio.
Fue concluido
que esta técnica
PCR-RAPD será
útil
para la identificación
de cultivos
de cebada maltera
de seis hileras.
Una versión
más rápida
de la técnica
podía
ser necesitada
para satisfacer
las necesidades
de la industria
procesadora
de cebada.