VIEW ARTICLE DOI: 10.1094/ASBCJ-54-0091
RAPD-PCR Characterization of Brewery Yeast and Beer Spoilage Bacteria. Thomas A. Tompkins (1), Robert Stewart, Louise Savard (2), Inge Russell, and Terrance M. Dowhanick (3), Research and Technical Services Department, Labatt Breweries of Canada, 150 Simcoe Street, London, Ontario, Canada N6A 4M3. (1) Present address: Lallemand Inc. Laboratoire R&D, 6100 Royalmount, Montreal, Quebec, Canada H4P 2R2. (2) Present address: Institute IRBV, 4101 Sherbrooke St. E., Montreal, Quebec, Canada H1X 2B2. (3) Author to whom all correspondence should be addressed: 519/667-7338; Fax 519/667-7350. J. Am. Soc. Brew. Chem. 54(2):91-96, 1996. Accepted September 13, 1995.
Commercially
available oligonucleotide
primers (10-mers)
were used in
a random amplified
polymorphic
DNA-polymerase
chain reaction
(RAPD-PCR) to
screen and characterize
potential beer-contaminating
bacteria. The
species identification
of Lactobacilli,
Pediococci,
Leuconostoc,
and others was
achieved using
four different
primers in the
RAPD-PCR. For
each bacterial
species, each
primer produced
a unique and
characteristic
"core"
fingerprint
pattern. Using
the core patterns
as a guide,
we were able
to distinguish
and recognize
unknown contaminants
obtained during
regular testing
by our quality
control laboratories.
The procedure
is faster than
traditional
characterization
techniques—the
identification
of a single
colony was typically
achieved in
less than 10
hr. Keywords:
Beer spoilage
microorganisms,
DNA fingerprinting,
PCR, RAPD.
Iniciadores
oligonucléotidos
disponibles
comercialmente
(10-mers) fueron
usados en una
DNA polimórfico
amplificado
al azar-reacción
de cadena de
polimerasa (RAPD-PCR)
para examinar
y caracterizar
bacterias contaminantes
potenciales
de cerveza.
La identificación
de especies
de Lactobacilli,
Pediococci,
Leuconostoc,
y otras
fue logrado
usando cuatro
diferentes iniciadores
en la RAPD-PCR.
Para cada especie
bacteriana,
cada iniciador
produjo un Cinico
y caracterlstico
patrón
de las huellas
digitales "núcleo."
Usando los patrones
núcleo
como una guía,
este laboratorio
ha sido exitosamente
capaz de distinguir
y reconocer
contaminantes
no conocidos
obtenidos durante
pruebas regulates
por nuestro
laboratorio
de control de
Calidad. El
procedimiento
ha resultado
ser más
rápido
que las técnicas
de caracterización
tradicional;
típicamente
la identificación
de una simple
colonia fue
lograda en menos
de 10 horas.